10月24日中超联赛第29轮，武汉三镇主场3-5不敌山东泰山，提前一轮降至中甲联赛。

2020赛季中乙联赛，武汉三镇在决赛中通过点球大战击败淄博蹴鞠，以冠军成绩晋级中甲。2021赛季中甲联赛，武汉三镇以25胜4平5负积79分的战绩夺冠。升入中超联赛的首个赛季，武汉三镇以25胜3平6负的成绩再次夺冠，完成了三级联赛三年三冠的壮举。

2023年8月28日，武汉三镇官方发布公告称球队投资方已无力继续运营俱乐部，并希望通过零转让方式完成股改。随后球队战绩也陷入动荡，并开始通过出售球员，降低成本等方式支撑运营。2023年9月，球队中场核心斯坦丘被出售至沙特联赛球队达马克。在这一年中超赛场上，武汉三镇最终以14胜9平7负的战绩，仅仅位列联赛第7名。

2024赛季随着韦世豪、谢鹏飞、戴维森等主力球员出走，武汉三镇彻底沦为保级球队，甚至在联赛下半程仅仅击败北京国安、深圳新鹏城和河南队，最终以8胜7平15负的战绩，位列联赛第11名，仅仅比降级线高出4分。

2025赛季武汉三镇摆脱欠薪困境，经营渐趋稳定，但是战绩依旧不佳。30轮联赛最终收获6胜7平17负，积25分位列联赛第13名，勉强保级。

2026赛季随着武汉金控集团加大投资，武汉三镇引进了卡迪斯在内多名强力外援，但是球队成绩依旧不见起色。最终在第29轮联赛3-5完败山东泰山后，以5胜12平12负的战绩，提前一轮降入中甲联赛。

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