E、F组中，日本、伊朗结束了最后一轮小组赛，虽都以1-2的比分失利，但两队还是进入了淘汰赛阶段：凭借此前的两连胜，伊朗就已锁定F组前两名的直接出线名额；日本负于巴拉圭后丢掉了E组第二，而在小组第三积分榜上有4队积到3分（泰国与越南积4分排名前两位），净胜球方面日本不敌末轮大胜的塞尔维亚，不过好在多于哥斯达黎加和危地马拉，才得以作为成绩第四好的小组第三惊险出线。 随着日本的压哨出线，亚足联的5支代表队全部晋级淘汰赛，分别是直接参赛的伊朗、日本、乌兹别克斯坦以及通过亚洲区附加赛的泰国、越南；再算上代表欧足联的哈萨克斯坦，本届五人制世界杯的十六强中足有6支亚洲球队。 小组出局方面，中北美足联则遭遇了全军覆没，通过中北美五人制锦标赛获得世界杯资格的四强哥斯达黎加、美国、危地马拉、巴拿马全部折戟小组赛；非洲代表仅有摩洛哥出线，埃及、安哥拉均排名垫底；东道主立陶宛与大洋洲独苗所罗门群岛也无缘淘汰赛。 十六强淘汰赛对阵情况如下（9月22-24日）： 委内瑞拉（A组第二）vs摩洛哥（C组第二）、巴西（D组第一）vs日本（E组第三，成绩第四好）、俄罗斯足球联盟（B组第一）vs越南（D组第三，成绩第二好）、阿根廷（F组第一）vs巴拉圭（E组第二）、西班牙（E组第一）vs捷克（D组第二）、葡萄牙（C组第一）vs塞尔维亚（F组第三，成绩第三好）、乌兹别克斯坦（B组第二）vs伊朗（F组第二）、哈萨克斯坦（A组第一）vs泰国（C组第三，成绩最好）